Алексей Романенко является высокопрофессиональным специалистом в области параллельного программирования и применения графических ускорителей для решения научных задач.

В 2009 и 2010 годах Алексеем прочитаны два курса для сотрудников Института цитологии и генетики СО РАН "Введение в параллельное программирование" и "Программирование на CUDA для задач биоинформатики", в ходе которых биоинформатики нашего института освоили современные методы параллельного программирования, как на кластерных суперкомпьютерных системах, так и на графических ускорителях.

Разработанный Алексеем алгоритм распараллеливания метода поиска вырожденных олигонуклеотидных мотивов в десятки раз ускорил расчеты, по сравнению с предложенной нами ранее однопоточной версией. Использование технологии CUDA позволило нам решать задачу выявления функциональных сигналов в регуляторных районах генов на персональных компьютерах без применения суперкомпьютеров.

По опыту нашей совместной работы могу рекомендовать Алексея для сотрудничества в области оптимизации, распараллеливания и ускорения методов компьютерного анализа.

н.с. Института цитологии и генетики СО РАН
к.б.н., О.В.Вишневский